Методы виртуального скрининга

flap_screening

Существует две широкие категории методов отбора в виртуальном скрининге: на основе лиганда и на основе структуры. Методы виртуального скрининга широко используются в анализе web-ресурсов с последующим повышением их коэффициента конверсии.
Практика показала успешность применения виртуального скрининга в web-разработках, о чем свидетельствуют о компании ингейт отзывы многочисленных клиентов. Компания является одним из лидеров в области интернет-маркетинга, применяющей в своей деятельности самые передовые методы.
На основе лигандов
Учитывая множество структурно разнообразных лигандов, которые связываются с рецептором, модель рецептора может быть построена за счет использования коллективной информации, содержащейся в таком наборе лигандов. Они известны как фармакофор-модели. Кандидат лиганд может быть сравнен с фармакофор-моделью, чтобы определить, является ли он совместим с ней. Другой подход на основе лигандов виртуального скрининга заключается в использовании 2D методики сходства химического анализа для сканирования базы данных молекул в отношении одного или более активных структур лиганда.
Популярный подход к лигандам на основе виртуального скрининга основаны на поиске молекул с формой, схожей на известные активы, например, такие молекулы, которые будут соответствовать месту связывания цели и, следовательно, вероятно, будут связывать цели. Есть целый ряд перспективных приложений этого класса методов в литературе.
На основе структуры
Метод отбора виртуального скрининга на основе структуры включает нахождение стыковочного кандидата лигандов в белком-мишенью с последующим нанесением оценочной функции для определения вероятности того, что лиганд связывается с белком с высокой степенью родства.